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淺析COIP的正確操作步驟!小編來帶你了解一下! 一、細(xì)胞的甲醛交聯(lián)與超聲破碎(第一天) 1.取出1平皿細(xì)胞(10cm平皿),加入243ul37%甲醛,使得甲醛的終濃度為1%(培養(yǎng)基共有9ml)。 2.37℃孵育10min。 3.終止交聯(lián):加甘氨酸至終濃度為0.125M。450ul2.5M甘氨酸于平皿中。混勻后,在室溫下放置5min即可。 4.吸盡培養(yǎng)基,用冰冷的PBS清洗細(xì)胞2次。 5.細(xì)胞刮刀收集細(xì)胞于15ml離心管中(PBS依次為5ml,3ml和3ml)。預(yù)冷后2000rpm5min收集細(xì)胞。 6.倒去上清。按照細(xì)胞量,加入SDSLysisBuffer。使得細(xì)胞終濃度為每200ul含2x106個(gè)細(xì)胞。這樣每100ul溶液含1x106個(gè)細(xì)胞。再加入蛋白酶抑制劑復(fù)合物。假設(shè)MCF7長滿板為5x106個(gè)細(xì)胞。本次細(xì)胞長得約為80%。即為4x106個(gè)細(xì)胞。因此每管加入400ulSDSLysisBuffer。將2管混在一起,共800ul。 7.超聲破碎:VCX750,25%功率,4.5s沖擊,9s間隙。共14次。 二、除雜及抗體哺育(第一天) 1.超聲破碎結(jié)束后,10000g4℃離心10min。去除不溶物質(zhì)。 2.留取300ul做實(shí)驗(yàn),其余保存于-80℃。 3.300ul中,100ul加抗體做為實(shí)驗(yàn)組;100ul不加抗體做為對(duì)照組;100ul加入4ul5MNaCl(NaCl終濃度為0.2M),65℃處理3h解交聯(lián),跑電泳,檢測超聲破碎的效果。 4.在100ul的超聲破碎產(chǎn)物中,加入900ulChIPDilutionBuffer和20ul的50xPIC。 再各加入60ulProteinAAgarose/SalmonSpermDNA。4℃顛轉(zhuǎn)混勻1h。 5.1h后,在4℃靜置10min沉淀,700rpm離心1min。 6.取上清。各留取20ul做為input。一管中加入1ul抗體,另一管中則不加抗體。4℃顛轉(zhuǎn)過夜。 三、檢驗(yàn)超聲破碎的效果(第一天) 1.取100ul超聲破碎后產(chǎn)物,加入4ul5MNaCl,65℃處理2h解交聯(lián)。 2.分出一半用酚/氯仿抽提。電泳檢測超聲效果。 四、COIP免疫復(fù)合物的沉淀及清洗(第二天) 1.孵育過夜后,每管中加入60ulProteinAAgarose/SalmonSpermDNA。4℃顛轉(zhuǎn)2h。 2.4℃靜置10min后,700rpm離心1min。除去上清。 3.依次用下列溶液清洗沉淀復(fù)合物。清洗的步驟:加入溶液,在4℃顛轉(zhuǎn)10min,4℃靜置10min沉淀,700rpm離心1min,除去上清。 洗滌溶液: (1)lowsaltwashbuffer-onewash ?。?)highsaltwashbuffer-onewash (3)LiClwashbuffer-onewash ?。?)TEbuffer-twowash 4.清洗完畢后,開始洗脫。 洗脫液的配方:100ul10%SDS,100ul1MNaHCO3,800ulddH2O,共1ml。 每管加入250ul洗脫buffer,室溫下顛轉(zhuǎn)15min,靜置離心后,收集上清。重復(fù)洗滌一次。最終的洗脫液為每管500ul。 5.解交聯(lián):每管中加入20ul5MNaCl(NaCl終濃度為0.2M)。 6.混勻,65℃解交聯(lián)過夜。 五、DNA樣品的回收(第三天) 1.解交聯(lián)結(jié)束后,每管加入1ulRNaseA(MBI),37℃孵育1h。 2.每管加入10ul0.5MEDTA,20ul1MTris.HCl(PH6.5),2ul10mg/ml蛋白酶K。45℃處理2h。 3.DNA片段的回收----omega膠回收試劑盒。最終的樣品溶于100ulddH2O。
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